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Secondo le statistiche prese dal database GISAID tra novembre e dicembre 2021, il 97% di tutte le varianti di SARS-CoV-2 con la mutazione NSP6 LSG105-107del è Omicron, mentre solo il 53% di tutte le varianti di SARS-CoV-2 con la mutazione S HV69-70del è Omicron.
La variante Omicron indica un possibile aumento della fuga immunitaria, della trasmissibilità e del rischio di reinfezione. Per questo motivo, nello screening di routine della SARS-CoV-2, oltre al rilevamento di tutte le varianti, è fondamentale testare e distinguere la mutazione NSP6 LSG105-107del per il rilevamento della variante Omicron. Poiché l'individuazione delle varianti è importante per l'epidemiologia, sono necessarie tecnologie diverse dall';analisi della sequenza del DNA per essere in grado di testare una percentuale molto più alta di casi sospetti in tempi molto più brevi.
I kit di rilevamento delle varianti nelle regioni in cui sono prevalenti diminuiranno il carico di rilevamento delle varianti con il sequenziamento del DNA. Inoltre, poiché fa parte dello screening di routine, le diminuzioni della prevalenza della variante Omicron possono essere rilevate velocemente, e gli studi per identificare il tipo di variante circolante nel campo invece della variante Omicron possono essere avviati rapidamente.
Uso previsto:
Il kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR è un test PCR di trascrizione
inversa in tempo reale e in un solo passaggio utilizzato per il rilevamento qualitativo e la distinzione dei geni ORF1ab e N specifici di SARS-CoV-2 della variante Omicron.
Obiettivo:
Il kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR oltre a mirare alle regioni del gene ORF1ab e N che sono comuni a tutte le varianti di SARS-CoV-2, miri alla mutazione NSP6 LSG105-107del per il rilevamento della variante Omicron. Gli obiettivi di SARS-COV-2 vengono letti nel canale FAM e la mutazione NSP6 LSG105-107del che rileva la variante Omicron viene letta nel canale Cy5 dello strumento Real Time PCR. Anche il gene RNase P, che ha come obiettivo un controllo interno, viene letto nel canale HEX.
Funzionamento e durata:
Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR kit, se usato con vNAT® Transfer Tube, rende il campione pronto per la Real Time PCR entro 5 minuti e fornisce il risultato della Real Time PCR in meno di 30 minuti di protocollo.
Dispositivi convalidati e compatibili:
Il kit Bio-Speedy® SARS-CoV-2 + Omicron RT-qPCR è convalidato per un volume di reazione di 10 µl sullo strumento Bio-Rad CFX96 Touch™ Real Time PCR.
